Sungai Suci yang berhulu di bagian selatan Plato Wonosari masuk ke dalam tanah melalui mulut Gua Suci. Sungai bawah tanah yang mengalir di dasar lorong sepanjang 100 meter tersingkap di dasar Luweng Glatikan di bagian sebelah selatan. Sungai ini masuk lagi ke dalam tanah, lalu muncul di Luweng Mburi Omah. Aliran bawah tanah sepanjang lebih dari 2 km muncul di dasar Luweng Grubug, sebuah sumuran (single-shaft) dengan kedalaman sekitar 98 meter. Debit air sungai bawah tanah yang besar menunjukkan adanya aliran air dari percabangan sungai bawah tanah di sekitarnya. Sungai bawah tanah ini akhirnya muncul di Pantai Baron, belasan kilometer di selatan Luweng Grubug. Kegiatan tubing menjadi daya tarik wisata di kompleks perguaan ini.